Monika Eigensperger begann 1980 als Freie Mitarbeiterin beim ORF-Radio, war Musikprogrammgestalterin und Reporterin bei Ö3 ("Zick Zack", "Radiothek") und ab 1992 Ressortleiterin bei Ö3 sowie ständige stellvertretende Ö3-Chefin (1994).
Seit 1996 ist sie Leiterin des Jugendkultursenders FM4. Unter ihrer Leitung avancierte FM4 zum Kultprogramm, der Sender bot Kreativen Spielraum zur Umsetzung von Erfolgsproduktionen ("Stermann & Grissemann", "Projekt X"). Die FM4 Corporate Identity wurde mehrfach ausgezeichnet.
Im November 1999 wurde Monika Eigensperger zur Senderchefin der 4. ORF-Kette FM4 bestellt.